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Nicht alle Traktate der Mischna haben den Gemara-Kommentar. Im palästinensischen Talmud sind von den 63 Traktaten der Mischna nur vierzig mit einem Gemara-Kommentar versehen. Indessen ist es nicht ausgeschlossen, dass früher auch für die andern Traktate Gemara vorhanden war, die aber im Laufe der Zeit verloren gegangen ist. Ein Theil dieser uns nicht überlieferten Gemara war in früheren Jahrhunderten bekannt. Der babylonische Talmud enthält die Gemara für sechs- oder siebenunddreissig Traktate. Einige Traktate haben die palästinensische Gemara, aber keine babylonische, andere wiederum babylonische, aber keine palästinensische.
Gegen Ende des fünften Jahrhunderts war der babylonische Talmud, von einigen geringfügigen späteren Interpolationen abgesehen, so ziemlich abgeschlossen. Es war somit die dritte Sammlung religiösen Schriftthums im Judenthum endgiltig festgestellt. Zuerst die Bibel, dann die Mischna, und jetzt nunmehr der Talmud.